عرفت مصر الفاطمية جوانح وآفات تعددت أسبابها بين شح المطر وانخفاض مستوى مياه النيل وفيضاناتها، ومحاربة طوائف الجند المختلفة بعضهم مع بعض وما نتج عن هذه الأسباب وغيرها من مجاعات وأوضاع اقتصادية متردية، وما رافقها من أوبئة مهلكة استمرت من سنة ٤٤٦هـ إلى ٤٥٤هـ /١٠٥٤-١٠٦٢م، وقد أودت هذه الشدة بحياة الكثيرين خاصة في عامي (٤٤٧ هـ – ١٤٨هـ / ١٠٥٥-١٠٥٦م). حيث كانت الوفيات تقدر يوميا بألف شخص وأكثر.